martes, 28 de enero de 2020

Biología Sintética: La nueva oportunidad para la independencia nacional.



La innovación científica y tecnológica durante las últimas décadas ha evolucionado a pasos agigantados y en el área de las ciencias biológicas no es la excepción, un ejemplo claro es el desarrollo de organismos generados en base a componentes sintéticos, como es el caso de la generación del primer microorganismo creado de manera artificial por the J. Craig Venter Institute, publicado el 20 de mayo de 2010, donde se logró generar una célula bacteriana con un genoma obtenido de forma completamente artificial, capaz de auto replicarse. Ésta nueva tecnología es conocida como biología sintética, que se define como el esfuerzo de diseñar nuevos organismos o modificar existentes, para producir nuevos sistemas biológicos, con una funcionalidad diferente o mejorada, de acuerdo a un criterio de diseño cuantificable, porque explícitamente esto requiere que el sistema biológico, sea evaluado en contra de un objetivo de criterio cuantificable, de igual forma que se realiza en ingeniería tradicional (Anderson et al. 2012).

Los Usos de biología sintética poseen un enorme potencial, en el desarrollo de nuevos organismos biológicos, capaces de llevar a cabo funciones útiles para la industria y la sociedad, tales como: degradación de desechos contaminantes, detección de agentes tóxicos en el agua, producción de biocombustibles, desarrollo de drogas entre otros. (Anderson et al. 2012).

La disciplina se puede clasificar según la manera en que se lleva a cabo el objetivo, por ejemplo es posible identificar 2 enfoques TOP-DOWN (de arriba hacia abajo) y BOTTOM-UP (de abajo hacia arriba). El primero consiste en rediseñar organismos o secuencias genicas preexistentes para remover regiones innecesarias, reemplazar, adicionar segmentos específicos para obtener nuevas características mejoradas o funciones. Por otro lado el enfoque BOTTOM-UP, es más nuevo y representa mayores desafíos, corresponde a la creación de sistemas biológicos vivos, a partir de materia cruda, usando como fuente componentes inertes (PCSBI, 2010).

A veces, la generación de sistemas biológicos artificiales, se caracteriza por crear circuitos a partir de componentes químicos sintéticos estandarizados, que poseen funciones deseadas preestablecidas, de una forma predecible, que pueden ser intercambiables. Es así como existe, por ejemplo una plataforma conocida como “biobricks”, que posee un registro de secuencias de ADN con funciones biológicas conocidas, como un catálogo de código abierto, disponible para usuarios, que mediante el uso de computadoras, pueden generar circuitos biológicos uniendo piezas, como si se tratara de piezas del conocido juego Lego®. (PCSBI, 2010).

Estos componentes estandarizados, están disponibles para el público en general y de forma gratuita, para promover y desarrollar la investigación en el área, con ello se realiza de manera anual, el concurso mundial de ingeniería de máquinas biológicas para estudiantes (iGEM : International Genetically Engineered Machine. PCSBI, 2010).

En nuestro país, ya se han realizado experiencias relacionadas a la aplicación de la biología sintética, desde hace algunos años, es así como en 2012 un grupo de alumnos de pregrado pertenecientes a la universidad Católica, han participado del concurso mundial, llevado a cabo en Massachusetts Institute of Technology (MIT), luego de ganar el tercer lugar en la competencia latinoamericana de iGEM. Su propuesta, llamada Luxilla, consistió en desarrollar una lámpara, en base a la emisión de bioluminiscencia en bacterias, que iluminan sólo de noche mientras que en el día, sintetizan el sustrato necesario para brillar (Universidad Católica , 2012).

El 2013 fue fundado en la Universidad de Chile el grupo OpenBio, cuyo principal objetivo es impulsar el desarrollo de la biología sintética, mediante la formación de una red de grupos y espacios para incentivar el I+D+i de forma abierta, colaborativa y sin fines de lucro, siguiendo como eje principal, el diseño y creación de sistemas biológicos, por biología sintética, desarrollar equipos de laboratorio a bajo costo y entregar a las personas las herramientas para desarrollar sistemas biológicos por sí solos, para aportar al desarrollo de la sociedad. Los integrantes de esta agrupación, presentaron el pasado año un proyecto en el concurso mundial iGEM para la elaboración de plástico biodegradable (PLA), usando bacterias Escherichia coli modificadas, para producir ácido láctico (monómero básico del material), como sistema biológico, y otras bacterias de la misma especie, que posee el circuito génico, para polimerizar y exudar el producto al medio extracelular (OpenBio UChile, 2016).

El miedo que genera la incertidumbre de los alcances de la nueva tecnología, y su impacto en el ecosistema y la humanidad, ha generado una gran expectación acerca de los avances en la materia, donde en algunos casos, existe una suerte de predicción apocalíptica, que tiende a especular que la biología sintética es un peligro que debe estrictamente regulado. Sin embargo, como toda nueva tecnología, es necesario tomar en cuenta todas las posibilidades para evitar al máximo generar daños, en cualquiera de los planos que pueda tener algún grado de influencia. Dana y colaboradores (2012), propone 4 pasos para evitar el desastre de la biología sintética: en primer lugar identificar las diferencias en la fisiología de los organismos naturales y sintéticos, e investigar cómo éstos pueden interactuar con el ambiente circundante, determinar la capacidad potencial de supervivencia de un organismo sintético (considerando su duración en años, si es que tiene capacidad de permanecer en estado de latencia) y la capacidad de competir, respecto a su contraparte no sintética, en tercer lugar la eventualidad que posee un organismo sintético, de cambiar o evolucionar (para determinar si puede persistir, diseminarse o alterar su comportamiento en ambientes naturales, incluso aquellos lugares que son considerados como inhóspitos), la rapidez para adaptarse y quizá la posibilidad de ocupar nuevos nichos ecológicos. Finalmente, en cuarto lugar, investigar acerca del riesgo de que hubiere de transferencia de genes, por la capacidad conocida de los microorganismos, de poder intercambiar material genético, o integrar ADN libre desde el ambiente. Conociendo dichas características, se puede determinas si existe riesgo de pasar, accidentalmente características como resistencia a antibióticos, que pueden tener una repercusión en la salud Humana.




Figura. Arabidopsis thaliana: Especie modelo para estudios de genetica en plantas posee un genoma relativamente pequeño, completamente secuenciado, además de poseer corto periodo de rotación y facilidad para producir grandes cantidades de semillas. Es la especie perfecta para cualquier trabajo relacionado a biología sintética, dado a que la mayoría de sus genes ya han sido estudiados.

Para hacer frente a los posibles riesgos, que posee el surgimiento de la nueva tecnología, se ha desarrollado una guía propuesta para realizar investigaciones y aplicaciones relacionadas a la biología sintética, basada en 5 principios fundamentales, que pueden ser generalizados al surgimiento de cualquier nueva tecnología (Gutman 2011):

  • (1) Principio de beneficencia pública (Public beneficence): consiste en Maximizar el beneficio y minimizar los daños. Debe aplicarse a nivel personal e individual, a la institucionalidad, a la comunidad y a nivel público. A nivel público la población y sus representantes deben ser vigilantes ante los riesgos y estar preparados, para revisar las políticas que persiguen los beneficios, que no consideren los posibles riesgos.


  • (2) Administración responsable (Responsible stewardship): Ser administradores responsables de la naturaleza, de la generosidad de la tierra y de la seguridad y cuidado del planeta. Nuevas tecnologías conllevan grandes desafíos, por la incertidumbre de los alcances que pueden tener, respecto a los beneficios y riesgos, Considerando la vida actual, las generaciones futuras y el medio ambiente. Vigilancia prudente. Consiste en establecer procesos para la evaluación de posibles beneficios, posibles riesgos de seguridad y plantear formas de protección, tanto antes como después de los proyectos que se llevan a cabo.


  • (3) Libertad intelectual y responsabilidad (intellectual freedom and responsibility): Debe promover el espíritu creativo de la innovación tecnológica. Pero considerar los posibles daños que puede generar, en todos los planos Principio de regulación parsimoniosa. Propone que la supervisión, es verdaderamente necesaria para garantizar la justicia, la equidad, la seguridad la búsqueda del bien público. “Con la suficiente libertad de operar , los logros del futuro pueden hacer discutibles los riesgos de hoy”.


  • (4) Deliberación democrática (democratic deliberation). Se refiere a la capacidad de realizar una toma de decisiones, de manera cooperativa, donde sea posible llegar a acuerdos, en casos de debate de puntos de vista opuestos, donde exista una activa participación de los ciudadanos. La idea central de este principio, es generar el espacio para el intercambio de ideas a nivel público, mediante la deliberación justificada, teniendo en cuenta el respeto frente a puntos de vista irreconciliables. Se promueve de esta forma, la búsqueda del interés público, por sobre el individual.


  • (5) Justicia y equidad (justice and fairness) Está relacionada a la distribución de los beneficios y de las responsabilidades, que trae consigo la innovación tecnológica, a través de la sociedad.




La sociedad como un todo, debe realizar esfuerzos para evitar la distribución injusta de los beneficios, que puedan alcanzarse a partir de la tecnología, tanto para las instituciones, como para personas de forma individual. Este principio, no solo contempla un grupo específico, si no mas bien, la comunidad internacional en su conjunto.

Las posibilidades de la biología sintética, pueden ser infinitas, y en este sentido Chile debe desarrollar sus propias capacidades, para contribuir en el desarrollo de la economía, dar oportunidades a la población, generar nuevos emprendimientos y nuevas fuentes de empleo. También abre la posibilidad a explorar, dentro de nuestra biodiversidad, nuevas características que podrían tener aplicaciones biotecnológicas, gracias a la amplia variedad de condiciones climáticas a lo largo del territorio, donde se pueden encontrar ambientes tan extremos, como el desierto en Atacama, climas lluviosos en Valdivia o el ambiente polar de la Antártica.

Junto con ello, también es imperante que se desarrolle la institucionalidad necesaria, para instruir respecto a los aspectos éticos y/o legales, para hacer uso de la biología sintética en todos los niveles, implicados en el posible ejercicio de la tecnología, empezando por las instituciones de educación superior, institutos de investigación, el sector privado y público. Y digo instruir, haciendo referencia al principio de regulación parsimoniosa, que debe ser aplicado ante el surgimiento de una nueva tecnología, pues es de suma importancia generar el ambiente propicio, para el desarrollo de nuevos emprendimiento y no generar un clima de hostilidad y reticencia al uso de biología sintética, basándose en especulaciones, que no poseen un fundamento científico que lo respalde.

Sin duda que la ética en estos aspectos, corresponde un pilar fundamental para que la aplicación de esta nueva herramienta, sea usada siempre en pos del bien común, donde la inculcación de valores morales, debería ser incluida en la base de los programas y planificaciones, desde la primera infancia, pasando por todo el ciclo de formación educacional. Enseñando por ejemplo el valor de la naturaleza, el respeto por la humanidad, la búsqueda del bien común y la responsabilidad de la ejecución de sus actos en cualquier aspecto de la vida.

Dado al estado actual en que se encuentra el avance de la disciplina, a nivel mundial, es probable que en nuestro país, comience a masificarse su uso y aplicación, que puede dar paso a nuevas condiciones, que podrán tener un impacto positivo en el desarrollo, incluso dar paso a la creación de tecnología nacional, que pueda dar respuesta a los requerimientos sociales, de auto solventar la dependencia energética o la solución a la problemática de la protección del recurso hídrico, etc.

Bibliografía.

Anderson j., n. Strelkowa, g. Stan, t. Douglas, j. Savulescu, m. Barahona And a. Papachristodoulou. 2012. Engineering and ethical perspectives In synthetic biology. European molecular biology organization . Science & society. Vol 13 ( 7).

Dana g., t. Kuiken, d. Rejeski and a. Snow. 2012. Four steps to avoid a Synthetic-biology disaster assess the ecological risks of synthetic microbes before they escape the lab. Nature. 483. Pcsbi, 2010. New directions, ethics of synthetic biology and emerging technologies. Presidential commission for the study of bioethical issues. Disponible en: file:///C:/Documents%20and%20Settings/Administrador/Mis%20documentos/curso%20bioetica/PCSBI-Synthetic-Biology-Report-12.16.10_0.pdf

Universidad católica, noticias. 2012. Alumnos UC representarán a chile en competencia mundial de biología sintética. Disponible en: http://www.uc.cl/la-universidad/noticias/8653-alumnos-uc-representaran-a-chile-en-competencia-mundial-de-biologia-sintetica Gutmann, amy . 2011. “the ethics of synthetic biology: guiding principles for emerging technologies,” hastings center report 41, no. 4 (2011): 17-22.

Openbio Uchile. 2016. Disponible en: http://openbio.cl/categoria/biologia-sintetica/

lunes, 27 de enero de 2020

Especies forestales, consumo de agua y su relación con el tipo de suelo en Chile

Existe una gran preocupación, por los diferentes sectores productivos en el mundo, dado a los efectos del cambio climático, sobre los recursos naturales y la limitación de la disponibilidad de agua en el futuro, debido a la disminución de las precipitaciones, que según proyecciones del departamento de geofísica de la universidad de Chile, se reducirán hasta en un 50% en la zona centro- sur de nuestro país (Garreaud 2011). Las principales fuentes de agua dulce que existen, se limitan al 2,5% del total del agua en el planeta, del cual sólo el 0,5 % no está congelado y corresponde a acuíferos, precipitaciones, lagos naturales, reservorios y ríos (corma 2015).

Las plantaciones forestales en el país, corresponden al tercer sector productivo, luego de la minería y la pesca, con una superficie plantada de 2.424.722 hectáreas, que representa el 3,2% de la superficie total nacional (Infor 2015). Por ello es de gran preocupación, el efecto de las plantaciones, sobre el recurso hídrico y la posible disminución, que pueden ejercer sobre las masas de agua, correspondientes a escorrentías en las cuencas hidrográficas, debido principalmente al potencial consumo de agua.

Las principales especies establecidas en el país, corresponden a Pinus radiata (59%), Eucalyptus globulus (23%) y E. nitens (10%), cultivadas por poseer cortos periodos de rotación y altas tasas de crecimiento. En la literatura, se reporta que P. radiata, produce 1.25m3 (Bren et al 2011) de madera por mega litro de agua (1 ML= 10e6 litros), mientras que las especies del género Eucalyptus, entre 1 a 5 m3 /ML (white et al 2009). Por otro lado, un informe de la Corma del 2015, indica que para producir 2 gramos de biomasa, se necesita 1 litro de agua en Eucaliptus, mientras que para pino, se genera 1 gramo de biomasa por litro.

El consumo de agua, por parte de las especies forestales, es menor si se compara con lo que consume la agricultura. La actividad Agrícola, es responsable del uso del 87% del total de agua fresca ocupada a nivel mundial. Como ejemplo, es posible encontrar referencias en la literatura, que indican que se necesitan 2500 a 5000 litros de agua para producir 1 kilogramo de arroz, para contrarrestar perdidas por evapo-transpiración, percolación e infiltración (Dvorak 2012). En la tabla 1 se compara el consumo de agua en especies agrícolas, versus Eucalyptus sp.

Tabla 1. Eficiencia de uso de agua, respecto a la biomasa total, en diferentes cultivos en Australia, según Dvorak 2012.



Uso de Agua por
biomasa total
Litros Por
Kilogramo
Algodón/café/plátano 3200
Girasol 2400
Arveja 2000
Arroz con cáscara 2000
Haba 1714
Caupí 1667
Soja 1430
Papas 1000
Sorgo 1000
Eucaliptus 785
mijo africano 592




Las especies forestales se encuentran establecidas en nuestro país, según la capacidad de los sitios para proveer de agua, nutrientes y otros factores edafoclimaticos, propicios para el crecimiento. Schlatter y Gerding (1995), han propuesto un sistema de clasificación, para determinar los principales factores, que inciden en el vigor de los árboles que se ven afectados principalmente por: macroclima, clima local, características y propiedades físicas y quimico-nutritivas del suelo.

Chile se divide en 6 regiones macroclimáticas pincipalmente (Schlatter e Hidalgo 1982), estas se caracterizan por el patrón de precipitaciones y las temperaturas que predominan durante el año (figura 1). En este contexto, es posible establecer que las variaciones en las precipitaciones y temperatura, permiten determinar que las mejores regiones para el establecimiento de plantaciones forestales, son las identificadas con los números 3 y 4 de esta clasificación. Sin embargo, en nuestro país existen diferencias establecidas por las condiciones orográficas, desde este a oeste, que también influyen en la disponibilidad hídrica y la presencia de microclimas. Por ello, dentro de cada región, se establecen diferentes distritos, considerando que el litoral, la cordillera de la costa, el valle, la precordillera y cordillera de los andes, poseen características diferentes. Se estima que cada 400 metros de altura, hay un descenso de temperatura de 2 º Celsius, además de un aumento de precipitación de 500mm en el promedio anual.





Figura 1 Mapa físico de Chile con la delimitación de las 6 regiones macroclimáticas. Se incluye un registro de las precipitaciones y temperatura de un año (2012) segun sitio: http://es.climate-data.org/location/2060/(adaptación realizada a partir del mapa publicado por Schlatter y Gerding en 1995)

Dentro de la misma región macro-climática, aún es posible ver diferencias en sentido latitudinal (existe una diferenciación pluviométrica y de temperaturas de norte a sur dentro de la región). Por ello, también se establece una subdivisión en distritos de crecimiento en este sentido.

Por otro lado, también es importante tomar en consideración, las características del suelo en el establecimiento de las plantaciones. Según Gerding (1991), los suelos pueden ser clasificados en : Arenales y dunas (A), Cenizas volcánicas holocénicas (C), Rojo arcilloso o volcánicos más antiguos(R), derivados de rocas metamórficas antíguas (M) y derivados de sedimentos marinos (S).

Cada uno con sus propiedades especiales, dentro de esta clasificación, se pueden identificar una serie de limitantes, para el desarrollo de plantaciones forestales, que inciden finalmente en la capacidad de los sitios para producir madera (Schlatter 2008).

Es conocido también, que la capacidad de captación de nutrientes, es un factor importante, en cuanto a la eficiencia de uso de agua y tolerancia a sequía, es por ello que un manejo integrado, que contempla suministración de fertilizaciones y control de la densidad de plantaciones, puede favorecer el mantenimiento de los niveles de producción, en especies forestales, ante eventos de sequía (White et al 2014)

Es importante valorar el establecimiento de plantaciones forestales, en distintos tipos de suelo, que la agricultura no puede ocupar, dado a la imposibilidad de generar rendimientos rentables.

Según un estudio de Bonelli y Schlatter (1995), el tipo de suelo rojo arcilloso, posee una alta variación en cuanto a profundidad (15 a 150cm), capacidad de agua aprovechable (20-140mm, profundidad arraigable y drenaje interno, de muy lento a moderado. Dentro de este tipo de suelos, existe una sub-clasificación, denominada de “Hondonadas”, que corresponde a suelos de baja productividad. Sin embargo, aún en este tipo de suelo, es posible establecer plantaciones (con bajos rendimientos o limitado a especies tolerantes a estrés hídrico), pero que establecen claramente la diferencia con la agricultura, donde no existe posibilidad alguna de establecer cultivos.

Para obtener las retribuciones económicas y productivas, es necesario considerar, las características del sitio, relacionadas en primer lugar, a las condiciones climáticas, en segundo lugar a las propiedades físicas y químico – nutritivas, que determinan finalmente la capacidad de las especies para soportar eventos de estrés hídrico.
Figura 2. Dosel de Eucalyptus globulus establecido en la zona costera de Concepción

Relacionando el tipo de suelo, con el uso de agua en plantaciones forestales, es posible determinar, que la importancia del recurso hídrico, radica no solo en el agua que pueda ser ocupada para consumo humano (6% del total de agua dulce disponible en el país), también es importante considerar, cuánta agua se utiliza para la producción de cultivos agrícolas (73%).

El efecto de las plantaciones forestales, sobre los caudales de cuencas hidrográficas, sólo será significativamente distinto a una pradera, cuando la superficie de las laderas, es menor a 2000 ha., sin embargo una plantación de rápido crecimiento, no es diferente a un bosque nativo, en cuanto a la disminución en e caudal de escorrentías (corma 2015).

Es necesario considerar también, el hecho que las plantaciones agrícolas, no pueden ser establecidas en sitios de baja calidad nutricional, y la tecnificación de los cultivos, no permite realizar plantaciones en sitios forestales. Actualmente, se realizan distintas iniciativas, que tratan de emplear nuevos sitios de bajo rendimiento, con largos periodos de escasez hídrica, mediante la introducción de nuevas especies forestales, como por ejemplo E. camaldulensis, que proviene de regiones áridas de Australia.

Respecto a la actividad productiva, relacionada al sector forestal, es posible indicar, que es necesario tomar conciencia, de que el recurso hídrico es de vital importancia, y en el futuro, la mega sequía por la que atraviesa nuestro país, dentro de muy poco tiempo, tendrá un impacto significativo en los rendimientos y la calidad de los productos.

Es por este motivo, que se deben hacer esfuerzos importantes, para generar variedades con mayor eficiencia del recurso hídrico, es decir, que puedan producir una mayor cantidad de madera, con una menor demanda de agua. Además, también se debe tomar en consideración, obtener variedades, con mayor nivel de tolerancia a la sequía, altas temperaturas extremas y estrés biótico, puesto que son las principales tensiones ambientales, que impactarán a las plantaciones, en el mediano plazo, tomando como referencia, los efectos del cambio climático en nuestro país.

En este sentido, la biotecnología vegetal es imprescindible, para apoyar el desarrollo de los programas de mejoramiento genético en Chile, dado a que durante la última década, el desarrollo de las nuevas plataformas de secuenciación de ADN, permiten elaborar nuevas herramientas, como por ejemplo, marcadores moleculares, para la selección asistida de variedades de mayor tolerancia al estrés, y de este modo contribuir y asegurar el futuro del recurso, ante el cambio climático proyectado.



Referencias

Dvorak, W. S. (2012). Water use in plantations of eucalypts and pines: a discussion paper from a tree breeding perspective. International Forestry Review, 14(1), 110-119.

Bren, l., Elms, S. and Costenaro, J. (2011). How Much Water Is Needed to Produce a Cubic Metre of Radiata Pine Log? Australian Forestry, Vol. 74, No. 2, June 2011:108–111.

Bonelli C. Schlatter, C. B. J. (1995). Caracterización de suelos rojo arcillosos de la zona Centro-Sur de Chile. Bosque, 16(2), 21-37.

Corma. (2015). El agua y las plantaciones forestales, aporte al conocimiento de la gestión sustentable. Disponible en http:www.corma.cl.

Infor 2015. Anuario Forestal. Chilean statistical yearbook of forestry. Boletín estadístico N° 150. Disponible en http://wef.infor.cl/publicaciones/anuario/2015/Anuario2015.pdf

Schlatter, J. E., & Gerding, V. (1995). Método de clasificación de sitios para la producción forestal, ejemplo en Chile. Bosque, 16(2), 13-20.

Schlatter, J. & Uteau, D. 2008. estimacion de la calidad de sitio y reconocimiento de factores limmitantes del suelo a través de una clave. Simposio internacional: Suelos, nutrición y sitio forestal en un contexto de ordenamiento territorial. Valdivia, Universidad Austral de Chile, Campus Isla Teja, 15 y 16 de marzo de 2013.

White, D. A., Crombie, D. S., Kinal, J., Battaglia, M., McGrath, J. F., Mendham, D. S., & Walker, S. N. (2009). Managing productivity and drought risk in Eucalyptus globulus plantations in south-western Australia. Forest Ecology and Management, 259(1), 33-44.

White, D. A., McGrath, J. F., Ryan, M. G., Battaglia, M., Mendham, D. S., Kinal, J., ... & Hunt, M. E. (2014). Managing for water-use efficient wood production in Eucalyptus globulus plantations. Forest Ecology and Management, 331, 272-280